La principal mecánica de Nelumbo es la posibilidad de recuperar los recuerdos perdidos de los habitantes de Nemsi y poder devolvérselos, con tal de paliar los
efectos del Nelumbo. No obstante, el jugador también puede modificar estos recuerdos, ya sea por sus motivos egoístas o con tal de ayudar a estos habitantes. Por ejemplo, una madre que no recuerda donde está su hijo y a lo largo del juego descubres que su hijo falleció en un accidente, ¿Le dirías la verdad o por el contrario le dirias que vive feliz en alguna otra parte del universo?

Nelumbo quiere tratar temas como el olvido y la memoria con proximidad y empatía y, sobre todo, dar la oportunidad al jugador para que se sienta identificado con las diferentes historias y personajes, enfocándonos en un público que valore una narrativa más profunda y compleja.